Kaf HaChaim on Orach Chaim 37:10 כף החיים על אורח חיים ל״ז:י׳

י) שם נהגו שלא להניחם כל היום וכו', ומ"ע כתב בתשובה סי' ט"ל שצריך להניחם פ"ב בתפלת המנחה' והביאו מ"א סק"ב, א"ר אות ב', וכ"כ הברכ"י אות ג', דרבים מיראי ה' נהגו להניחם בתפלת המנחה ומנהג נכון הוא. וכ"כ בשער הכוו' דף נ"ב ע"א שהאר"י ז"ל היה נזהר מאד לאומרה בטלית ותפילין, ובראשונה היה נוהג להניח במנחה תפילין כהברת ר"ת, ואח"כ עשה זוג תפילין ע"ד שמושא רבא והיה מניחם בתפלת המנחה וכן הוא בשער הכוו' דרוש ו' דתפילין, והבאתי לשונו בסה"ק קול יעקב סי' ל"ד אות ד', (ועי"ש על סעי' ג' קצת דינים השייכים לזה הענין), ומשמע שם בשער הכוו' דרוש ו' דאין מועיל תפילין ע"ד שמושא רבא במקום רש"י ור"ת אלא לתפלת מנחה לבד אבל לא לתפלת שחרית. וכ"כ בנה"ש דף כ"ה ע"א הנד"מ בשאלות חכמי המערב אות ע"ו, וכ"כ המחב"ר בסי' ל"ד אות ח' יעו"ש: