Kaf HaChaim on Orach Chaim 90:22 כף החיים על אורח חיים צ׳:כ״ב

כב) שם וטוב שיהיו בבהכ"נ י"ב חלונות, כתב ל"ח ס"פ אין עומדין נראה ודאי שאלו א"צ שיהיו כולם נגד ירושלם וגם לפי הטעם מבואר שלכל הצדדין יהו פתוחין, והביאו א"ר אות ג' והסו"ב במק"ח אות א' כתב דאלו הי"ב חלונות הם כנגד י"ב צרופי הוי"ה וטוב שיהיו ג' בכל צד עכ"ד.. וכ"כ העט"ז אות ג' שזקינו הגאון היה לו בהכ"נ בק"ק ווינא ובנה בה י"ב חלונות ג' מכל צד, וכ"כ החס"ל אות ב':