Kaf HaChaim on Orach Chaim 127:7 כף החיים על אורח חיים קכ״ז:ז׳

ז) שם שאתה הוא וכו' בברכת מודים שאתה הוא ה' אלהינו צריך לומר השין פתח ככתוב שאתה מדבר עמי ועוד דאיכא מאן דקרי שי"ן סין ונראה ח"ו שיאמרו שה אתה ויעבוד למזל טלה מפי הגאון מהר"ר יהודה ממינדאילו, וכ"כ הגאון מהר"מ ממודינא שהיה בזמן מהר"י קוצין בליקוטיו כ"י, ויראה דלדידן יושבי ארץ הצבי וכל גלילותנו צחי הלשון דאומרים על ימין ימין אין לחוש לומר שאתה בפתח ואף דבכתוב נמצא שאתה בפחת כבר המפ' פירשו כמו שאתה בסגול, ואם ככתוב נקרא לטעם ורמז נסתר לא יחויב לומר תיבת שאתה בכל מקום בפתח, והגאונים הנז' אטעמא אחרינא סמכי ואיברא דבגלילות שאין ניכר במבטא שלהם בין ימין לשמאל יש בהן בפותח ויש ליזהר בדבר, אך מנהג כל העולם להיפך ולא ראיתי ולא שמעתי מי שנזהר בזה ברכ"י בשיו"ב אות ב':