Kaf HaChaim on Orach Chaim 48:9 כף החיים על אורח חיים מ״ח:ט׳

ט) שם בהגהה. דוגמת התורה שניתנה ברתת. וז"ל הרד"א די"ח ע"ג ונהגו ישראל להתנועע בשעה שקורין כי כנשמתה התורה נרתעו כולם שנאמר וירא העם וינועו. וכ"כ ריב"ה ברמזיו על התורה שם בפ' יתרו וז"ל וירא העם וינועו על כן מתנענעים בשעת לימוד בתורה לפי שהתורה ניתנה באימה ברתת בזיע ע"כ. יפה ללב אות ז':

ט) וז"ל הזוה"ק פ' פינחס סוף דרי"ח ע"ג נשמתהון דישראל אתגזרו מגו בוצינא קדישא דדליק דכתיב נר ה' נשמת אדם וכו' נהרא דשרגא כיון דאתאחדא גו פתילה ההוא נהורא לא שכיך לעלמין אלא מתנענעא נהורא לכאן ולכאן ולא משתכיך לעלמין. כגוונא דא ישראל דנשמתייהו מגו ההוא נהורא דשרגא כיון דאמר מלה חדא דאורייתא הא נהורא דליק ולא יכלין אינון לאשתככא ומתנענען לכאן ולכאן ולכל סטרין כנהורא דשרגא דהא נר ה' נשמת אדם כתיב עכ"ל, משמע דהנענוע הוא בשעה שלומד בתורה אבל לא בשעת התפלה שהיא בקשת רחמים ע"כ יש ליזהר בשעת תפלת י"ח שלא להתנועע וכמש"ל אות ז':